항원결정기(epitope)
정의
항체와 결합하는 항원의 특정 부분
- 항원결정기와 결합하는 항체 쪽 카운터파트를 paratope(항원결합부) 라고 한다.
항원결정기 종류
1. 구조적(3차원적) 항원결정기(conformational epitope)
단백질 3차원 접힘 과정에서, 불연속적 아미노산 배열이 형성하게 되는3차원 구조. 90% 가량의 항원결정기가 여기 속한다. 단백질이 접힘 상태일 때만, 항체가 구조적 항원결정기 인식할 수 있다. 단백질이 변성 되면서 접힘 풀리면 항체가 항원결정기 인식할 수 없다. 구조적 항원결정기는 항상 단백질 구조 표면(exterior)에 존재한다.
2. 선형 항원결정기(linear epitope)
연속적 아미노산 배열이 형성하는 3차원 구조. 단백질 변성 여부 상관없이, 항체가 선형 항원결정기 인식할 수 있다. 선형 항원결정기는 단백질 구조 표면 뿐 아니라, 3차원 구조 내부(interior)에 존재할 수도 있다. 이 경우엔 단백질을 변성 시켜 접힘을 풀어야 항체가 항원결정기 인식할 수 있다.
*구조적 항원결정기와 선형 항원결정기 모두 3차원 구조를 띄고 있다. (3차원 구조라 부르기 어려운 아미노산 잔기 하나, 작은 폴리펩티드 조각 일 수도 있다)
*선형 항원결정기의 3차원 구조는 기본적으론 항원결정기 부분 구성하는 아미노산 시퀀스가 결정(1차구조)하는데, 항원결정기 부분에 속하지 않는 나머지 전체 아미노산 배열도 선형 항원결정기 3차원 구조 형성에 영향 미친다.
*항원결정기(epitope) 마다 생긴 구조가 다르기 때문에, 항체의 항원 결합부(paratope)는 이 구조에 마치 퍼즐처럼 들어맞아야 둘이 결합된다. (결합 $\Rightarrow$ host의 생체 내에서 항원 제거)
항원결정기 표현한 그림
항원결정기에 항체가 결합
선형 항원결정기와 구조적 항원결정기 표현한 그림
[ 이미지 출처: https://microbeonline.com/epitope/ ]